دانشکده بهداشت مشهد ریشه‌ای دیرینه دارد و فعالیت رسمی آن به دهه ۱۳۶۰ بازمی‌گردد. این دانشکده در سال ۱۳۸۸ به‌عنوان واحدی مستقل از دانشکده علوم پیراپزشکی جدا شد و فعالیت خود را در محل فعلی آغاز کرد. دانشکده بهداشت در تربیت نیروهای متخصص در رشته‌های مرتبط با سلامت عمومی، بهداشت محیط و مبارزه با بیماری‌ها نقش مهمی ایفا کرده است و هم‌اکنون یکی از مراکز علمی فعال دانشگاه علوم پزشکی مشهد به‌شمار می‌رود.